福建永安人。字以贊，號海日。萬曆三十五年進士。

初任廣西梧州推官，後代理知府。他對該州地方民情了解甚深，當他發現由於商稅過重，束縛經濟發展的情況後，即上疏說:梧州地處偏僻荒涼，各種民族雜居，除產稻穀之外，沒有別的特產，所以大商人都不到這裡來。過去只有竹、木、皮革等物品徵收少量稅收，以補充薪餉之不足。自從上司派稅使入境以來，全州各縣到處設榷場(專賣場所)，商販經過榷場必須納稅才准行。一樣物品要經過兩三場甚至四五場，場場收稅，而進行買賣的物品大都是米谷等農產品，就是一件蓑衣，一頂斗笠也都要強迫到榷場買賣，收取稅款，這就很不利於經濟發展。經過嚴九岳的請求，終於免除這種苛捐雜稅。於是該州的商品交流活躍起來，人民貧困狀況有所改變。不久，嚴九岳奉調到朝中，任戶部主事。曾去督運通州的糧餉，發現船主怕運官糧，原因是官糧經常滯留停運，影響船主的收入。嚴九岳採取日夜不停連續運輸的方法，船主就積極承擔運輸，因而很快完成了糧餉督運任務。又遇北方邊境軍事緊張，嚴九岳奉命運輸軍用物資到邊境去。如果延誤，將嚴懲不貸。嚴九岳晝夜兼程，全力以赴，將全部軍用物資如期運到邊境，供給前線將士。朝廷下詔升嚴九岳為奉政大夫，命他出任岳州(今湖南嶽陽)知府。不料未到任即急病逝世，年四十七歲。

嚴九岳有遺著《笱存集》，此書的清朝刻本，在貢川民間尚有保存。